从 FASTA 到基因与蛋白质
沿着真实 HBB 与 HBD 转录本提取编码区，将翻译结果与 RefSeq 注释逐字核对。
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BIOINFORMATICS / 01–08
生物信息学
8 个独立可运行的课程，连接问题、可追溯输入、透明方法与结果解释。只需下载一个 notebook，即可开始每个工作流。
序列路径 01 → 02 → 06；表达路径 03 → 04 → 05；药物结构路径 06 → 07 → 08
下载本学科中英文课程合集8 recipes
比对 β 与 δ 珠蛋白基因
实现仿射缺口全局与局部比对，跟随回溯路径，准确理解一致性、覆盖率及评分。
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探索真实的配对 RNA-seq 实验
检查 63,677 个基因与 8 个 airway 样本，归一化测序深度，区分供体与处理效应并查看配对变化。
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检验响应候选基因的通路富集
定义实际测量的背景集合，用超几何模型检验真实 Reactome 通路，并对完整检验族校正。
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解读蛋白质物理互作网络
将 12 个 DNA 损伤响应蛋白映射到 STRING，保留孤立节点，比较阈值并查看证据来源。
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在三维空间中分析血红蛋白
旋转真实 1A3N 坐标，观察血红素与邻近残基，将结构链编号与 RefSeq 蛋白序列联系起来。
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小药物怎样放进蛋白质口袋？
用伊马替尼与 ABL 的真实模型，像观察小积木放进凹槽一样，找到药物和它旁边的蛋白小部件。
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抗体怎样贴在蛋白质表面？
用曲妥珠单抗与 HER2 的真实模型，跟着三种颜色，看看抗体的一部分怎样贴在蛋白表面。
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